卵子试管婴儿与普通试管婴儿的最大区别在于卵源的不同，所以流程上跟普通试管婴儿的差别不大，主要包括进周前检查、匹配卵源、促排取卵（捐卵者）、胚胎移植、抽血验孕等5个环节，各个环节的具体时间安排如下：
身体检查
进周前，夫妻双方都要进行全面的身体检查，确保患者的身体情况适合进行卵子试管婴儿治疗。其中，女方一般需要做妇科检查、血常规、雌性激素六项和阴道B超等检查，前两者随时都可以进行，后两者则需要在月经第2~3天进行。男方主要做血常规和精液化验，后者在禁欲后3~7天进行。所有检查项目通常10天就能完成，但患者若做染色体检查的话，结果一般要一个多月后才出来，所以建议患者在进周前检查环节预留1~2个月的时间，若身体存在一些影响卵子治疗的问题，也可以利用这段时间进行调理和治疗。
匹配卵源
受政策影响，国内公立医院基本都处于卵源“零库存”的状态，患者一般要等个三五年才有卵源。如果患者找私立机构的话，机构通常会根据患者的要求，如从年龄、学历、血型、身高等方面进行卵源的匹配，该过程一般需要1~2个月。
促排取卵（捐卵者）
卵源匹配完毕之后，在捐卵者月经第2天进周，开始为期10~12天促排卵。在取卵前一天晚上，医生会为患者注射一针HCG，然后在第二天上午（捐卵者月经第13~14天）进行取卵手术。另外，取卵当天，男方同样需要到医院进行取精。
胚胎移植
经过处理之后，精卵子会被放置在有特殊培养液的培养皿中进行受精。在患者身体情况允许的情况下，胚胎培养3~6天就可进行移植；如果患者身体未达标或是需要染色体筛查及基因诊断的话，则需要将胚胎冷冻起来，待合适的时机再进行冻胚移植。而胚胎移植术其实是一个小手术，10分钟左右就能完成。
抽血验孕
一般情况下，胚胎进入子宫腔内3~4天后就会着床，但胚胎着床时间受个体差异影响，有些患者的胚胎着床时间比较晚。因此，为了提高验孕准确度，医生通常建议患者在移植14天后到医院抽血验孕。若成功怀孕的话，14天后还需要进行B超检查，排出宫外孕。
